Nuestra misión es investigar, conservar, recuperar y defender la diversidad ambiental y sociocultural desde diferentes enfoques disciplinarios, promoviendo la reflexión en la sociedad acerca del uso irracional de los recursos naturales, generando propuestas desde el desarrollo sustentable y el fortalecimiento del conocimiento tradicional de la cultura colombiana.
El principal objetivo es velar por el patrimonio cultural y ecológico del país, desde el apoyo y la promoción de estrategias de autogestión de las comunidades locales, para que puedan consolidar sus proyectos productivos, ambientales, de energías limpias y de eco turismo comunitario en armonía con el territorio.